自机要费案被起诉以来，陈水扁律师团就极尽拖延之能事，吴淑珍更是连续十六次请假不出庭，其他被告也多半不配合，陈水扁更亲自介入，先是申请“释‘宪’”，继而又以“有造成‘国家’安全危险之虞”为由，要求将全部相关单据“归还‘总统’本人”，但法院只同意“不公开”，却裁定还是要继续审理。 陈水扁干脆将机要费相关证据资料、发票，甚至是他和吴淑珍的笔录等重要证据，核定为永久不得公开的“绝对机密”。换言之，检察官侦查所得的所有犯罪证据，在法官审理时即无法使用，相干人犯当然就没有一个能够定罪。报道说，如此釜底抽薪的手段，不可谓不厉害，但既违法，也有违情理。 按照台湾的法令规定，“总统”除犯内乱或外患罪外，非经罢免或解职，不受刑事上的诉究，亦即“总统”在任内犯法虽有赦免权，卸任之后还是要受刑事上之诉究。可是，现在陈水扁这么一来，今后所有的“总统”都可以放心大胆的作奸犯科，为所欲为。因为，任何不利于“总统”的证据，“总统”都可以将其核定为永久保密的“机密”，既无法追查，自然也就不会有罪。